テフロンコーティングがはがれてきている内容として、推測される要因としては、使用条件が特殊な場合と考えます。
テフロンは、常温から数十度程度の温度域では耐薬的に対応できそうですが、100度を超える天板温度でのご使用で薬液がこぼれた、或いは、水滴としてビーカーを伝った形で天板へ付着したと考えた場合に、薬液は非常に濃縮された形となりテフロン皮膜を攻撃します。
テフロン皮膜は、アルミ無垢に比較し、耐薬的な保護の為のものですが、板状のものではなく（板状であればホットプレートの役をなさない）、熱伝導性などを考慮し、薄膜となっていますので、上記のような強酸と高温の条件では、はがれていない他の機種も、はがれる可能性があるといえます。
上記のような強酸をご使用されるならば、天板はセラミックタイプをお勧めいたします。