ＰＣにデータ送信する際に、現状の温度が計測されないように
パソコン上に転送ストップボタンを押して記録を止めることは可能です。
取扱説明書をご参照ください。
しかし本ソフト・ロガーにはあいにく「中断」機能がございませんので、
ストップボタンを押した時点で、ロギングは終了します。
再度、パソコン上のスタートにてロギングを開始頂き、
データをエクセルに展開いただき、
エクセル上で二つのデータを合体させる方法をご検討頂けませんでしょうか？

尚、「push to run」モードでは、
マグネットホルダーにマグネットを2秒以上挿すことで記録を開始します。
このモードはセットアップの後近い内に（すぐにではなく）、
データーの記録を開始したい場合、
もしくは具体的に決められていない時間に記録を開始したい場合に便利です。